2.1. Điều trị trào ngược
Để điều trị bệnh Barrett thực quản thì bước đầu tiên là phải điều trị trào ngược. Việc điều trị trào ngược sẽ giúp làm giảm các triệu chứng mà bệnh nhân đang gặp phải. Thông thường, bệnh nhân sẽ được chỉ định sử dụng thuốc ức chế axit. Nhiều trường hợp được khuyên sử dụng thuốc ức chế axit suốt đời.
2.2. Theo dõi
Nếu bệnh nhân được chẩn đoán mắc bệnh Barrett thực quản thì sẽ được chỉ định nội soi dạ dày và sinh thiết định kỳ để theo dõi sức khỏe, nắm được tình trạng bệnh, diễn tiến của bệnh. Mẫu sinh thiết giúp phát hiện loạn sản đã phát triển trong những tế bào hay chưa, nhất là loạn sản mức cao có thể dẫn đến ung thư thực quản.
Tùy từng trường hợp, thể trạng và mức độ nặng của bệnh mà thời gian bệnh nhân được chỉ định làm định kỳ nội soi dạ dày và lấy mẫu sinh thiết khác nhau. Có thể là từ 3 – 6 tháng/lần đối với bệnh nhân phát hiện tế bào loạn sản, 2 – 3 năm/lần với bệnh nhân không có tế bào loạn sản. Nếu loạn sản mức cao phát triển, bác sĩ có thể đề nghị bệnh nhân thực hiện phẫu thuật cắt hớt niêm mạc thực quản loạn sản.
Trên thực tế, giá trị chính xác của việc theo dõi trong điều trị Barrett thực quản vẫn còn nhiều tranh cãi. Nhiều bác sĩ cho rằng hầu hết các bệnh nhân có thực quản Barrett không tiến triển thành ung thư, rất ít bệnh nhân có loạn sản mức cao. Việc nội soi dạ dày và phẫu thuật cắt hớt niêm mạc có thể dẫn đến nhiều biến chứng. Do đó, Barrett thực quản điều trị bằng theo dõi vẫn còn gây tranh cãi về lợi ích và nguy cơ của nó. Tùy từng trường hợp, bác sĩ sẽ cân nhắc lợi và hại để tư vấn cho bệnh nhân phương pháp tốt nhất.
2.3. Phẫu thuật
Trường hợp bệnh nhân Barrett thực quản có loạn sản mức cao hoặc đã tiến triển thành ung thư thực quản thì sẽ phải điều trị bằng phương pháp phẫu thuật cắt bỏ phần thực quản. Cuộc phẫu thuật này có thể gây nhiều biến chứng nguy hiểm, thậm chí có thể ảnh hưởng đến tính mạng người bệnh.